Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法


						mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小，拍摄日期等等，那么如何可视化图像呢？





import cv2

import SimpleITK as sitk

import matplotlib.pyplot as plt

import numpy as np

image =sitk.ReadImage(path)

image = sitk.GetArrayFromImage(image)

#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer

plt.imshow(image,cmap='gray')

plt.axis('off')

plt.show()

cv2.imwrite('1.png',image)



这里path是mhd文件的路径，并且在该路径下需要有相应的raw文件

这里展示一下我的mdk文件和保存的png文件





在这里如果cv2和ITK模块没有的话可以用pip安装





pip install opencv-python 

pip install SimpleITK





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